Без заголовка
Насчет нижнего уровня (кеши, прокси и т.д.) -- не знаю, не знаю ;)
Что касается problem tracking, то у нас реализовано уже две системы на эту тему -- Коммуникатор и ARENA. Насчет всяческого органайзинга -- на эту тему и livejournal думает (to do в нем почти работают :)
А насчет "провязанности единой системой категорий" -- так это главное, чем мы сейчас занимаемся. Так, при разработке CommuniBase тип website снова был переведен из системых в пользовательские (так, у отдельных пользователей ЖЖ никаких их "вебсайтов" нету -- только наборы страниц. Мы сейчас и это выразить можем ;)
Если веб-проекты с "единой системой категорий" -- то это к нам, однозначно...