Без заголовка
Список Долинского -- это логика, ничего больше. По-хорошему, логику тоже нужно тренировать, но я не уверен, что в курсе системного мышления (в принципе, если подставлять в список Долинского онтологемы системного мышления в качестве операндов, то это и будет основа для тренинга -- поэтому я список Долинского и привёл).
В мыслемах же самого системного мышления у меня явно не Essence только. И онтологическая разноуровневость, конечно, присутствует. Умение работать с несколькими онтологическими уровнями важно. У Долинского, насколько я понимаю, это спрятано в "Операции на множестве: классификация, структуризация, обобщение".
Тут нужно ещё заметить, что я не полностью понял, что вы имеете ввиду, когда пишете "смешение понятий разного уровня", ибо вполне возможно, что мы уровни понимаем по-разному. Обычно "уровень" в онтологиях через отношение классификации задаётся (и репрезентация это специализация классификации обычно), а в системах -- через композиции. В любом случае, многоуровневую работу нужно тренировать, связанные с многоуровневостью понятия должны присутствовать.