Re: возможно заинтересует...

тогда делайте SVG-графы. Кроме neato на больших объемах ненаправленных графов можно попробовать FDP или CIRCO. Кстати, реально большие графы я бы не стал описывать на дот. Лучше описать в виде Python-словарей, программой построить по ним граф, и сгенерировать набор диаграмм - и полную, и большой набор контекстных (все соседи в пути не больше 3). Ну и вообще это даст на порядок больше гибкости, при не меньшем удобстве. DOT-язык хорош именно при коллективной быстрой работе с небольшими графами. Для больших графов с которыми непонятно как манипулировать, лучше сразу в виде программных структур описывать (можно и более простой свой DSL придумать).