Без заголовка
Фон Неймановская архитектура ЭВМ - это вообще 1940-50 гг, поэтому отсылка к датам не вполне понятна, поскольку вы сейчас набиваете этот текст опираясь на всю ту же концепцию 70-летней давности.
Если под онтологией вы понимаете концетуальные модели предметной области (или области знаний), то, разумеется, к своему словарю она не сводится. Но без функциональной модели, получаемой при анализе или синтезе с помощью SADT обойтись вряд ли получится.
И еще я не разглядел в тексте важный вопрос: цель построения онтологии. Очевидно, что без неё исследователь будет вынужден оперировать философским, а не научным понятием с соответствующим нулевым результатом. "Выпей моря, Ксанф" (с)