Без заголовка
Извините за недопонимание.
1) Полностью согласен - но эта проблема будет у всех мат ориентированных языков: Matlab/R/Octave/Mathematica/Numpy
2) Быстрые циклы на inline C++ - это стандартное решение, к сожалению по моему мнению тяжелее поддерживать. Сейчас идет сильное течении использовать разного типа jit оптимизации - LuaJIT, тоже самое для Питона, поэтому скоро разрыв менжду for циклами в C и JIT оптимизированных языках сократится.
3) Есть задачи которые просто не ложатся в векторную оптимизацию - например преобразование Хофа (Радона) и активно используются в распозновании изображений. Поэтому я ждал julia 0.3 чтобы активно попользовать - используя старые наработки из матлаба.