Без заголовка

Стек чего-то (протоколов, например) -- это обычное слово для модульного описания: именно что стопка слоёв. Если дерево/иерархия, то там о стеке не говорят обычно. Стек появился бы в том случае, когда все эти прототипы-типы или образцы-результаты не имели бы права использовать элементы через уровень (ибо "стеки" это всегда про видимость интерфейсов). А тут действительно какие-то странные типы отношений, в том числе и отношения порождения (в смысле generative grammar): какая-то архитектура как набор синтаксических ограничений порождает все возможные конструкции в рамках этих ограничений. В программировании это обычно описывается не как стеки, а как цепочки (chains).