Без заголовка
Ничего не знаю о корпоративных нуждах, но все же: почему же Protege+OWL — десктопная связка? OWL (web ontology language) сам по себе никак не привязан к десктопу, и Protege с вебом дружит. Кроме WebProtege для совместной работы над OWL онтологиями есть еще как минимум http://knoodl.com/ui/home.html, это навскидку.